Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nfe2Q07279 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms