Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cab39Q06138 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms