Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs3Q05895 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms