Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms