Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top1Q04750 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1Q04750 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Top1Q04750 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top1Q04750 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top1Q04750 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms