Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Emx2Q04744 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Emx2Q04744 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms