Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thbs2Q03350 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms