Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp39Q02525 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms