Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms