Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VcpQ01853 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VcpQ01853 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VcpQ01853 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VcpQ01853 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VcpQ01853 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms