Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mc1rQ01727 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms