Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp1Q01514 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms