Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2aQ01320 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2aQ01320 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms