Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2cQ01098 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2cQ01098 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms