Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms