Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms