Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1cQ00896 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1cQ00896 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms