Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabpaQ00422 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms