Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb1Q00420 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms