Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms