Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms