Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cds1P98191 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cds1P98191 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds1P98191 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds1P98191 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms