Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4cP97470 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp4cP97470 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms