Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas1P97459 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas1P97459 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas1P97459 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms