Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prop1P97458 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prop1P97458 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prop1P97458 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prop1P97458 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prop1P97458 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prop1P97458 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prop1P97458 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prop1P97458 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prop1P97458 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms