Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhodP97348 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhodP97348 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RhodP97348 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhodP97348 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhodP97348 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RhodP97348 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhodP97348 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhodP97348 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhodP97348 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhodP97348 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhodP97348 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhodP97348 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhodP97348 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhodP97348 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhodP97348 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhodP97348 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhodP97348 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhodP97348 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhodP97348 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RhodP97348 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms