Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkdcP97313 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkdcP97313 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms