Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vgll3P85442 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms