Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpcaP84075 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpcaP84075 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms