Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx2P81066 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx2P81066 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms