Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx2P80206 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx2P80206 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx2P80206 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx2P80206 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms