Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1bP70700 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr1bP70700 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms