Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ldb1P70662 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms