Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad50P70388 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad50P70388 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad50P70388 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad50P70388 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad50P70388 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad50P70388 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad50P70388 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad50P70388 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad50P70388 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad50P70388 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms