Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp4P70343 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp4P70343 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp4P70343 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp4P70343 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms