Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms