Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx6P70327 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx6P70327 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms