Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Cux2P70298 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cux2P70298 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cux2P70298 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cux2P70298 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux2P70298 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux2P70298 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux2P70298 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux2P70298 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux2P70298 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Cux2P70298 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cux2P70298 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cux2P70298 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cux2P70298 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cux2P70298 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cux2P70298 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux2P70298 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cux2P70298 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms