Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp7P70280 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms