Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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