Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms