Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms