Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms