Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3P62908 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps3P62908 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms