Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl31P62900 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms