Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3cP62823 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms