Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta2P62737 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms