Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arf6P62331 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arf6P62331 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arf6P62331 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arf6P62331 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arf6P62331 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arf6P62331 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arf6P62331 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arf6P62331 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms