Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd2P62317 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd2P62317 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd2P62317 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms