Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms